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數(shù)字PCR(Digital PCR,dPCR)是一種核酸分子絕對定量技術,它通過直接計數(shù)DNA分子的個數(shù)來實現(xiàn)對起始樣品的絕對定量。
作為基于微流控的新一代PCR技術,這三點優(yōu)勢讓它能在一眾PCR檢測手段中突出重圍。
絕對定量:
數(shù)字PCR能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),實現(xiàn)對起始樣品的絕對定量,避免了傳統(tǒng)定量PCR中相對定量的局限性。
高靈敏度:
數(shù)字PCR能夠檢測出低頻率的突變和表達變化,提高了檢測的靈敏度和準確性。
可靠性:
數(shù)字PCR采用統(tǒng)計學原理進行數(shù)據(jù)分析,能夠降低實驗誤差和假陽性率,提高結(jié)果的可靠性。
從實驗流程上看,數(shù)字PCR檢測可分為以下四個步驟:
圖一:數(shù)字PCR檢測標準流程展示
隨著檢測通量以及實驗樣本處理方式的復雜度持續(xù)升級,體系制備成為了讓科學家們頭疼的難題,主要體現(xiàn)在體系配置工作量大,手工重復性差,前處理耗時長等。
為幫助科學家們在體系配置上的難題,小貝為科學家們推薦一款輔助工具——Biomek i系列自動化移液工作站。
自動化ddPCR(微滴式數(shù)字PCR)體系配置
高通量處理:
自動化ddPCR系統(tǒng)能夠一次性處理大量樣本,大大提高了實驗通量,減少了人工操作的時間和誤差。
圖二:以多重數(shù)字PCR檢測重組腺相關病毒(rAAV)病毒基因組拷貝數(shù)實驗流程為例,1小時可完成6*96個待測樣本的體系配置。
降低人工成本:
自動化ddPCR系統(tǒng)可以減少對專業(yè)操作人員的依賴,降低人工成本。
圖三:自動化軟件dPCR全流程自動化程序展示。標準化實驗流程,全自動化完成,無需人員進行實驗操作
結(jié)果保障:
可重復性,精確度高,穩(wěn)定的結(jié)果輸出。
圖四:圖A為自動化標準品梯度稀釋試驗,結(jié)果表明定量限可低至 20 拷貝/反應,檢測限可至 5~10 拷貝/反應,ddPCR 方法能更好的用于標準品的定量和殘留檢測。
圖B為 AAV 基因組滴度檢測的代表性圖譜,通過對 自動化AAV 樣品的前處理,再通過 ddPCR 系統(tǒng)進行液滴生成并進行 PCR 擴增后讀取液滴信號,結(jié)果表明使用 ddPCR 對病毒滴度進行檢測,其結(jié)果陰陽性區(qū)分明顯,易于分析,結(jié)果準確,并且相同樣品不同天檢測 CV 值 ≤10%。
未來數(shù)字PCR可拓展的應用領域:
精準醫(yī)學:
數(shù)字PCR在精準醫(yī)學領域的應用將進一步拓展,包括基因表達差異研究、拷貝數(shù)變異(CNV)研究、腫瘤治療的伴隨診斷等。通過數(shù)字PCR技術,可以實現(xiàn)對基因表達的精確定量,為疾病的診斷和治療提供有力支持。
環(huán)境監(jiān)測:
隨著全球?qū)ι锇踩铜h(huán)境保護的重視,數(shù)字PCR在環(huán)境監(jiān)測領域的應用也將逐漸增多。通過數(shù)字PCR技術,可以檢測和監(jiān)測環(huán)境中的致病微生物和污染物,為環(huán)境保護和公共衛(wèi)生安全提供重要保障。
農(nóng)業(yè)遺傳改良:
在農(nóng)業(yè)領域,數(shù)字PCR技術可以用于農(nóng)作物基因變異的檢測和分析,為育種工作提供有力支持。通過數(shù)字PCR技術,可以更加精確地檢測和分析農(nóng)作物中的基因變異,為培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病的農(nóng)作物品種提供技術支持。
貝克曼庫爾特生命科學提供專業(yè)的軟件硬件支持,以及客戶應用開發(fā)來滿足大家對于生命科學自動化的需求。
關于貝克曼自動化整合部門介紹:
1 貝克曼庫爾特生命科學自動化整合部門位于美國Indianapolis,該部門位于Beckman質(zhì)量管理系統(tǒng)下,并經(jīng)過ISO9001認證,部門配備整合實驗室,完成整合設備的研發(fā)。
2 整合部門人員包含機械、電子、軟件、系統(tǒng)工程師,和工程師支持、項目管理人員。人員配備齊全,售前售后響應快速。
3 如有特殊功能開發(fā),Beckman團隊可協(xié)助客戶在國內(nèi)進行軟硬件開發(fā)和測試。
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